Testen Sie unsere Datenanalysetools

Hauptkomponentenanalyse (PCA)

Das PCA-Tool ist ein wertvolles Werkzeug zur Untersuchung und Interpretation komplexer Metabolomik-Datensätze und hilft bei der Identifizierung biologisch relevanter Marker und dem Verständnis metabolischer Mechanismen. Dieses intuitive Tool ermöglicht Ihnen die einfache Untersuchung und Visualisierung von Daten zur Beantwortung grundlegender Forschungsfragen und kann als Ausgangspunkt für Forscher dienen. Das PCA-Tool bietet anpassbare Funktionen, um Ihren Anforderungen gerecht zu werden, und ermöglicht Ihnen die autonome Untersuchung von Daten im Einklang mit Ihren Forschungszielen. Mit diesem Tool verfügen Sie über eine ganzheitliche Kontrolle, um das metabolische Profil der Studiengruppen besser zu interpretieren und Hypothesen zu bilden sowie interessante Muster oder Metaboliten aus der Visualisierung und den Datenexporten zu identifizieren.

Partielle Diskriminanzanalyse nach der Methode der kleinsten Quadrate (PLS-DA)

PLS-DA spielt eine zentrale Rolle in der Metabolomik-Analyse und bietet einen leistungsstarken statistischen Rahmen für die Aufklärung komplexer Beziehungen innerhalb hochdimensionaler Datensätze. PLS-DA ist eine überwachte Methode zur Dimensionsreduktion, die im Gegensatz zu PCA Klassenbezeichnungen in die Analyse einbezieht. Es entdeckt latente Variablen (Komponenten), die die Trennung zwischen verschiedenen vordefinierten Gruppen (z. B. gesund vs. krank) in den Daten maximieren. Durch die Projektion der Daten auf diese latenten Variablen erfasst PLS-DA die Varianz- und Korrelationsstruktur in den Daten, die für die Gruppendifferenzierung am relevantesten sind. Aufgrund seines überwachten Charakters erfordert PLS-DA eine sorgfältige Parametrisierung und ein Verständnis der zugrunde liegenden Daten.

Vulkandiagramm

Das Vulkandiagramm ist ein leistungsstarkes Visualisierungstool, das die statistische Signifikanz mit dem Ausmaß der Änderung der Metabolitenwerte kombiniert, um die biologisch relevantesten Metaboliten in Ihrer Studie hervorzuheben. Der Vulkanplot von Metabolon ermöglicht Ihnen das Herunterladen hochauflösender Grafiken, die zur Veröffentlichung bereit sind, und bietet anpassbare Funktionen, um Ihren spezifischen Anforderungen gerecht zu werden.

Clustering-Analyse

Clustering ist eine grundlegende Methode im Bereich der Datenanalyse und Bioinformatik und wird zur Gruppierung von Entitäten auf der Grundlage ihrer Ähnlichkeiten verwendet. Diese Technik ist von entscheidender Bedeutung für die Offenlegung der inhärenten Strukturen in Daten und führt häufig zu aufschlussreichen Entdeckungen in verschiedenen wissenschaftlichen Bereichen. Das Erfassen der Nuancen der Bündelung kann Ihr Verständnis der verborgenen Muster und Beziehungen Ihrer Daten erheblich verbessern. Unser Clustering-Analysetool identifiziert auf intelligente Weise die optimalen Gruppierungsparameter und ermöglicht so eine einfachere Analyse komplexer Daten.

Pathway Enrichment

Die Pathway-Analyse ist ein leistungsstarkes Werkzeug in der Bioinformatik und Systembiologie. Es bietet Kontext und Interpretation verschiedener biologischer Wege, um das komplexe Zusammenspiel von Genen, Proteinen, Metaboliten und anderen molekularen Einheiten zu verstehen. Durch die Analyse dieser Stoffwechselwege können Forscher aufdecken, wie verschiedene biologische Prozesse funktionieren und interagieren, was zu neuen Erkenntnissen über Krankheitsmechanismen, therapeutische Ziele und mehr führt. Im Wesentlichen ist die Signalweganalyse in der Metabolomik unverzichtbar, um aus komplexen Metabolitennetzwerken aussagekräftiges biologisches Wissen zu extrahieren und zu Fortschritten sowohl in der Grundlagenforschung als auch in der translationalen Forschung beizutragen.

Biomarker-Linsen™

Das Biomarker Lenses™-Tool wendet fortschrittliche Analysefilter an, die die Untersuchung metabolomischer Daten verbessern, indem sie sich auf Metaboliten konzentrieren, die mit bestimmten biologischen Funktionen, Signalwegen oder Krankheiten verbunden sind. Die Filter fungieren als Lupe und heben relevante Teilmengen von Daten für eine eingehende Analyse hervor. Mit diesem Ansatz können Sie die große Auswahl an Metaboliten durchsehen und sich auf diejenigen konzentrieren, die für eine bestimmte biologische Untersuchung relevant sind. Auf der Bioinformatik-Plattform von Metabolon sind drei Arten von Biomarker-Linsen™ verfügbar: Pathway Biomarker-Lenses™, Disease Biomarker-Lenses™ und Custom Biomarker-Linsen™.

Der Discovery Panel-Bericht

Im Discovery Panel Report können Sie alle erkannten Metaboliten in einem Blasendiagramm visualisieren. Sie können statistische Vergleiche auswählen, den p-Wert anpassen, die Faltungsänderung umkehren und über die Symbolleiste oben nach einem Metaboliten von Interesse suchen. Sie können auch die deutlich hoch- und runterregulierten Metaboliten erkunden. Identifizieren Sie innerhalb des Blasendiagramms schnell wichtige Metaboliten und klicken Sie auf diese Metaboliten, um mehr zu erfahren. Der Benutzer kann auch ein Bild des Blasendiagramms herunterladen, das für die Weiterverwendung außerhalb des MyMetabolon-Portals umfunktioniert wurde.

Impact Explorer

Impact Explorer ist der nächste Schritt, um tiefer in Ihre Discovery Panel-Daten einzutauchen. Wählen Sie bis zu sechs statistische Vergleiche aus, um sie in der Heliogramm-Visualisierung anzuzeigen. Dabei handelt es sich um eine Neuinterpretation einer Heatmap von Metabolitenfaltungsänderungen, gruppiert nach Pfad und organisiert in einer kreisförmigen Ansicht. Sie können auf bestimmte Metaboliten oder Assoziationen klicken und die Beziehung zwischen den Gruppen anzeigen. Darüber hinaus können Sie für jede Ansicht, die Sie im Heliogramm interessant finden, eine Bilddatei herunterladen.

Metabolite Profile Finder

Der Metabolite Profile Finder kann verwendet werden, um einen bestimmten Metaboliten oder Signalweg von Interesse zu untersuchen. Sie können auf beide zugreifen, indem Sie auf den Reiter „Profile Finder“ klicken oder von dem Reiter „Discovery Panel Report“ aus navigieren. Im Metabolite Profile Finder sehen Sie eine Übersicht über den Metaboliten, der Sie interessiert. Diese Seite enthält Links zu PubChem, KEGG und HMDB für weitere Informationen. Sie können auch sehen, wie dieser Metabolit in den einzelnen Studienvergleichen statistisch dargestellt wurde. Schließlich können Sie auch die mit einem bestimmten Metaboliten verbundenen Assoziationen sehen.